RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 A6NJR5 290 aa22.9■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.9■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.9■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.9■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.9■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 ZWILCHQ9H900 591 aa22.9■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.9■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 NRCAMQ92823 1304 aa22.89■■□□□ 1.26
SPHK1-201ENST00000323374 ACSL3O95573 720 aa22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 TTC4O95801 387 aa22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 DPH6Q7L8W6 267 aa22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 NLRP14Q86W24 1093 aa22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 EMC1Q8N766 993 aa22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 E7EVH7 732 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 GPR32O75388 356 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SEC24CP53992 1094 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ACAP1Q15027 740 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ALLCQ8N6M5 410 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SNTG2Q9NY99 539 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 F2P00734 622 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SLCO1A2P46721 670 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 P3H1Q32P28 736 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 MFSD5Q6N075 450 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 UBA3Q8TBC4 463 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.88■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 KAT6AQ92794 2004 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 FAM107AO95990 144 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 IL1R2P27930 398 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 PPARDQ03181 441 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 STILQ15468 1287 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 NOTUMQ6P988 496 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 MIS12Q9H081 205 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 RNF8O76064 485 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ITGAVP06756 1048 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 MMP13P45452 471 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 IRF5Q13568 498 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 HAUS1Q96CS2 278 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SNX27Q96L92 541 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 CPA4Q9UI42 421 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.87■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 GMNCA6NCL1 334 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 TRAPPC3O43617 180 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 CYP2C9P11712 490 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 KDELR1P24390 212 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 KYNUQ16719 465 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 MORN1Q5T089 497 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 RELL1Q8IUW5 271 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 KAT2BQ92831 832 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 OSMRQ99650 979 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.86■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ARSEP51690 589 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 PLCB3Q01970 1234 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 MAP2K5Q13163 448 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 TTC13Q8NBP0 860 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 CENPTQ96BT3 561 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 PWWP2AQ96N64 755 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINB12Q96P63 405 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 CITO14578 2027 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.85■■□□□ 1.25
SPHK1-201ENST00000323374 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms