RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592535.5

APOC1-208, Transcript of apolipoprotein C1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene APOC1, Length 430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1-208ENST00000592535 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GPR88Q9GZN0 384 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 IL21Q9HBE4 155 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.89□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 LRRN2O75325 713 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 FGF19O95750 216 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PSMC3P17980 439 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 LHX1P48742 406 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CASP4P49662 377 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CYP4F8P98187 520 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DPYDQ12882 1025 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GPR158Q5T848 1215 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DPH6Q7L8W6 267 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PJA1Q8NG27 643 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 BRD9Q9H8M2 597 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DMAC2Q9NW81 257 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.88□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PATJQ8NI35 1801 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 HEPACAM2A8MVW5 462 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PDXKO00764 312 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ATP2C2O75185 946 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ZNF202O95125 648 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GLULP15104 373 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CD72P21854 359 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CYP2F1P24903 491 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 LMO2P25791 158 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PCSK1P29120 753 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CDC25CP30307 473 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GDI1P31150 447 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ANGPT1Q15389 498 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TAF12Q16514 161 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DNASE1L2Q92874 299 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 MMS19Q96T76 1030 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SYT15Q9BQS2 421 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ABCB6Q9NP58 842 aa14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 RHOBTB3O94955 611 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 NR3C1P04150 777 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PDGFRBP09619 1106 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 MYL6P60660 151 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TRPC3Q13507 836 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DDR2Q16832 855 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 FAM171BQ6P995 826 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 E2F7Q96AV8 911 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 GCNAQ96QF7 691 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TASP1Q9H6P5 420 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CDH9Q9ULB4 789 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 NME7Q9Y5B8 376 aa14.86□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SHISA7A6NL88 538 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 ZNF263O14978 683 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PHACTR2O75167 634 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 PRAMEF12O95522 483 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 F11P03951 625 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CSH1P0DML2 217 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CSH2P0DML3 217 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 NLRP12P59046 1061 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TNNC1P63316 161 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 DLG4P78352 724 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 NUCB2P80303 420 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 BIRC3Q13489 604 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
APOC1-208ENST00000592535 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms