RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPC5P78333 572 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEAD2Q15562 447 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF12Q16514 161 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 FLCNQ8NFG4 579 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF516Q92618 1163 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP54Q96N23 3096 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PRU2 124 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRBA1A5PL33 1030 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSH1P0DML2 217 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSH2P0DML3 217 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPR3P17342 541 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 RFX1P22670 979 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 NR2F2P24468 414 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 BIRC3Q13489 604 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR72Q3MJ13 1102 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 COBLL1Q53SF7 1204 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP135Q66GS9 1140 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM171BQ6P995 826 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 OSTM1Q86WC4 334 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYT15Q9BQS2 421 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX25Q9H3E2 840 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CA14Q9ULX7 337 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOBPA7XYQ1 873 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GABRR2P28476 465 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 WEE1P30291 646 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGEA11P43364 429 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASP4P49662 377 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYL6P60660 151 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKCQQ04759 706 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNOCQ13519 176 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCOA4Q13772 614 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 POTEHQ6S545 545 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAREM2Q75VX8 874 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA20Q8TB22 786 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF4BQ92750 862 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNASE1L2Q92874 299 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PI4K2AQ9BTU6 479 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 P4HA1P13674 534 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJA1P17302 382 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMC3P17980 439 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 STARD6P59095 220 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF699Q32M78 642 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZACNQ401N2 412 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 VSTM1Q6UX27 236 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPV5Q9NQA5 729 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 STK25O00506 426 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT13P13646 458 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP2F1P24903 491 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMO2P25791 158 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 VAMP7P51809 220 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAM9Q13443 819 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC44A4Q53GD3 710 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM186BQ8IYM0 893 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GIPC2Q8TF65 315 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 IRF7Q92985 503 aa18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms