RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCB6	Q9NP58	842 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	23.36	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SHISA7	A6NL88	538 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOC3	O60645	756 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMC3	P17980	439 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN10	P78369	228 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DPYD	Q12882	1025 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	BECN1	Q14457	450 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	VEPH1	Q14D04	833 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC142	Q17RM4	750 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM171B	Q6P995	826 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DNASE1L2	Q92874	299 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	23.35	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PDXK	O00764	312 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOBTB3	O94955	611 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GLUL	P15104	373 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	RFX1	P22670	979 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	LMO2	P25791	158 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PCSK1	P29120	753 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GIPC2	Q8TF65	315 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	OBSL1	O75147	1896 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP54	Q96N23	3096 aa		23.34	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	WEE1	P30291	646 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP4	P49662	377 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR15	P49685	360 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F7	Q96AV8	911 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	BRD9	Q9H8M2	597 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		23.33	■■□□□ 1.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	ARNTL	O00327	626 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF202	O95125	648 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2F1	P24903	491 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF7	Q92985	503 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	NME7	Q9Y5B8	376 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRD	P23468	1912 aa		23.33	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2C2	O75185	946 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRN2	O75325	713 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	TACC1	O75410	805 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	CD72	P21854	359 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC25C	P30307	473 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	GDI1	P31150	447 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGPT1	Q15389	498 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR158	Q5T848	1215 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	TASP1	Q9H6P5	420 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH9	Q9ULB4	789 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		23.32	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	PROB1	E7EW31	1015 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	F11	P03951	625 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	NR3C1	P04150	777 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM163B	P0C2L3	166 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	NBL1	P41271	181 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRP12	P59046	1061 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	MYL6	P60660	151 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4F8	P98187	520 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	DDR2	Q16832	855 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	STKLD1	Q8NE28	680 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT15	Q9BQS2	421 aa		23.31	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	23.3	■■□□□ 1.32
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	23.3	■■□□□ 1.32

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