RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ZNF516	Q92618	1163 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	IRF7	Q92985	503 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MYRFL	Q96LU7	910 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	OBP2A	Q9NY56	170 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.32	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137		H0Y858	1186 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ARNTL	O00327	626 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	IKBKB	O14920	756 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MAPK13	O15264	365 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SOAT2	O75908	522 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ZNF202	O95125	648 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	KIF20A	O95235	890 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CSH1	P0DML2	217 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CSH2	P0DML3	217 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GLUL	P15104	373 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GJA1	P17302	382 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CDC25C	P30307	473 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ATIC	P31939	592 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NBL1	P41271	181 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MAGEA11	P43364	429 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MRE11	P49959	708 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ENPEP	Q07075	957 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	VIT	Q6UXI7	678 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FSIP1	Q8NA03	581 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TMC2	Q8TDI7	906 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TASP1	Q9H6P5	420 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	BRD9	Q9H8M2	597 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CDH9	Q9ULB4	789 aa		12.31	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FAM186A	A6NE01	2351 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CHAD	O15335	359 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	F11	P03951	625 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GABRR2	P28476	465 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	VIPR2	P41587	438 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MAGEA9	P43362	315 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	VSTM1	Q6UX27	236 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CLDN23	Q96B33	292 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.3	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	STK25	O00506	426 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MAN2B1	O00754	1011 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NOL4	O94818	638 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NR3C1	P04150	777 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	CYP2F1	P24903	491 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	LMO2	P25791	158 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	12.29	□□□□□ -0.44	5e-8	■■■■■ 43.3
CS-223	ENST00000551137	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	NLRP12	P59046	1061 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ANGPT1	Q15389	498 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GPR158	Q5T848	1215 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	GIPC2	Q8TF65	315 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		12.29	□□□□□ -0.44
CS-223	ENST00000551137	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.29	□□□□□ -0.44

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