RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF21B	O75037	1637 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MATN2	O00339	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC14B	O60729	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NDST3	O95803	873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MCM7	P33993	719 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK9	P45984	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGA8	P53708	1063 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	DGCR2	P98153	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CREM	Q03060	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	DPT	Q07507	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	POSTN	Q15063	836 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT40	Q6A162	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	MUL1	Q969V5	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-222	ENST00000545308	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087WWL8	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087WZ62	844 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ACKR2	O00590	384 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	NRP1	O14786	923 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	AREL1	O15033	823 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	THAP12	O43422	761 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC5C	O95185	931 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GNAI3	P08754	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	RARB	P10826	455 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP5J	P18859	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC11A2	P49281	568 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GZMK	P49863	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	UCP3	P55916	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GNAI1	P63096	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	NFYC	Q13952	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	CFHR4	Q92496	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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