RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555905.5

TMEM260-208, Transcript of transmembrane protein 260, human

TSL 5

Gene TMEM260, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM260-208	ENST00000555905	THAP12	O43422	761 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	MED7	O43513	233 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	AKR1B10	O60218	316 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CD19	P15391	556 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	PCSK1	P29120	753 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CCZ1B	P86790	482 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	FUT10	Q6P4F1	479 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM169	Q96HH4	297 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CHP1	Q99653	195 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	GDF15	Q99988	308 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	VDR	P11473	427 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	LMO2	P25791	158 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	RGS19	P49795	217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CDR2	Q01850	454 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	KRT17	Q04695	432 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ORC1	Q13415	861 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	SPA17	Q15506	151 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	SGO2	Q562F6	1265 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ACOT1	Q86TX2	421 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	OSTM1	Q86WC4	334 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TWNK	Q96RR1	684 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905		H7C4K7	107 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	OAZ2	O95190	189 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CALCA	P01258	141 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	FGFR3	P22607	806 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	BMP8B	P34820	402 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	KIF11	P52732	1056 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	RABGGTB	P53611	331 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TSPY1	Q01534	308 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	STIL	Q15468	1287 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ACBD6	Q9BR61	282 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	GBF1	Q92538	1859 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	FGF18	O76093	207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	NDUFA10	O95299	355 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	MME	P08473	750 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TMEM260-208	ENST00000555905	CHRNB2	P17787	502 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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