RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480155.1

SHOC2-204, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 2

Gene SHOC2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-204	ENST00000480155	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	USP19	O94966	1318 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155		F5H697	171 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	TPP1	O14773	563 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	GRP	P07492	148 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	BMP5	P22003	454 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	TGM1	P22735	817 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC7A1	P30825	629 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	ADRA1B	P35368	520 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	MPL	P40238	635 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	NDUFV1	P49821	464 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	UCP3	P55916	312 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	COL10A1	Q03692	680 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	TCF15	Q12870	199 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155		Q6ZNX1	250 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	LNX2	Q8N448	690 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155	MAST3	O60307	1309 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SHOC2-204	ENST00000480155		A0A0B4J269	797 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155		E7ENX8	843 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MGST3	O14880	152 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TBX3	O15119	743 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	RHO	P08100	348 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TYRP1	P17643	537 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	AVPR1B	P47901	424 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC11A2	P49281	568 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	ARFIP2	P53365	341 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	LILRA4	P59901	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TAP2	Q03519	686 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MPP3	Q13368	585 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TUBB3	Q13509	450 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	GBX1	Q14549	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MAML1	Q92585	1016 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	YY2	O15391	372 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	ESRRB	O95718	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CHRM2	P08172	466 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	PDHA1	P08559	390 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	ITGAL	P20701	1170 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	GPSM2	P81274	684 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CTBP1	Q13363	440 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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