RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 KPNA5O15131 536 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 FGF18O76093 207 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ABHD16AO95870 558 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 GJB1P08034 283 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TSHRP16473 764 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC6A4P31645 630 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 STT3AP46977 705 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 GRM7Q14831 915 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 USP40Q9NVE5 1235 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 LAMC1P11047 1609 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 BTN3A1O00481 513 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MFAP3LO75121 409 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 CHEK2O96017 543 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 GNAI2P04899 355 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 GNAT2P19087 354 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MGAT1P26572 445 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MXRA7P84157 204 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TCF15Q12870 199 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM209BQ5JX69 171 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 XP32Q5T750 250 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ST8SIA2Q92186 375 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TFAP2CQ92754 450 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SCAMP4Q969E2 229 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 PRAM1Q96QH2 718 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SIK2Q9H0K1 926 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 DLC1Q96QB1 1528 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MSH6P52701 1360 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 POM121BA6NF01 834 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TBC1D4O60343 1298 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TOM1O60784 492 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TCEA3O75764 348 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 C8AP07357 584 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 CFPP27918 469 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 KCNJ5P48544 419 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 NOMO3P69849 1222 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 STK3Q13188 491 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 CSRP2Q16527 193 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ERAP2Q6P179 960 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 C1QL4Q86Z23 238 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 FITM2Q8N6M3 262 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MAML1Q92585 1016 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SERHLQ9NQF3 203 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ADAMTS20P59510 1910 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 A0A1W2PPC4 97 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 F8W8V4 182 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TRIM13O60858 407 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 RAD17O75943 681 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 DNAJB5O75953 348 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 TXKP42681 527 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC13A2Q13183 592 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 RAB32Q13637 225 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF124Q15973 351 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MICU3Q86XE3 530 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 XYLT1Q86Y38 959 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGAP1-210ENST00000480054 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms