RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438929.5

BDNF-210, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,059 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-210ENST00000438929 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.46□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 PHLPP1O60346 1717 aa6.46□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.46□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ALS2Q96Q42 1657 aa6.46□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 DYTNA2CJ06 578 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 F5H423 210 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 PIK3CDO00329 1044 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 SORBS3O60504 671 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ETS1P14921 441 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 AMPD1P23109 780 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 PTGIRP43119 386 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 SIK1P57059 783 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 CDK16Q00536 496 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 GSTA3Q16772 222 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 LPCAT4Q643R3 524 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 PADI6Q6TGC4 694 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 PCGF5Q86SE9 256 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 TTC7BQ86TV6 843 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 DCLK3Q9C098 648 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 USP20Q9Y2K6 914 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 E2F8A0AVK6 867 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ESYT2A0FGR8 921 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 KRT38O76015 456 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ALADP13716 330 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 RGS2P41220 211 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 SLC25A3Q00325 362 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 STX3Q13277 289 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ZBTB33Q86T24 672 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 KCTD6Q8NC69 237 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 HSPH1Q92598 858 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 HAS1Q92839 578 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 EME1Q96AY2 570 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 SERPINI1Q99574 410 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ATRNO75882 1429 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ZBTB39O15060 712 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 TBC1D12O60347 775 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 GDF11O95390 407 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 CYP11B1P15538 503 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 LIG4P49917 911 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 SERPINB8P50452 374 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 COPAP53621 1224 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 OCRLQ01968 901 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ACVR2BQ13705 512 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 SATL1Q86VE3 508 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.45□□□□□ -1.38
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BDNF-210ENST00000438929 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 GGA1Q9UJY5 639 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 TMCO1Q9UM00 188 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 GNPATO15228 680 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 FKBP6O75344 327 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 DGKIO75912 1065 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 PROCP04070 461 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 KRT19P08727 400 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 WEE2P0C1S8 567 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 SLC1A1P43005 524 aa6.45□□□□□ -1.38
BDNF-210ENST00000438929 CDK7P50613 346 aa6.45□□□□□ -1.38
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