RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 WDR26Q9H7D7 661 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 DMTF1Q9Y222 760 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ISM1B1AKI9 464 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 GPANK1O95872 356 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CD1AP06126 327 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 SBK3P0C264 359 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 CXADRP78310 365 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CREMQ03060 361 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MPP3Q13368 585 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CNGA2Q16280 664 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 EMC10Q5UCC4 262 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 DPP9Q86TI2 863 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 OR2C3Q8N628 320 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 DEPTORQ8TB45 409 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SLC9A6Q92581 669 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 RIPOR3Q96MK2 946 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MYOCQ99972 504 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA1586Q9HCI6 787 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TBX3O15119 743 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SLC6A2P23975 617 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 PIK3CGP48736 1102 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 HSD11B2P80365 405 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 ZNF543Q08ER8 600 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 FOXI1Q12951 378 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 KRT72Q14CN4 511 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ERAP2Q6P179 960 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 GPR149Q86SP6 731 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PRIMA1Q86XR5 153 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 FITM2Q8N6M3 262 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 IL17RDQ8NFM7 739 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 SUCLG2Q96I99 432 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 BOD1Q96IK1 185 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 Q96MF0 132 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF287Q9HBT7 754 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 GALNT9Q9HCQ5 603 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CNNM1Q9NRU3 951 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 STK32BQ9NY57 414 aa3.55□□□□□ -1.84
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