RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 IMPACTQ9P2X3 320 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CDH9Q9ULB4 789 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM265A0A087WTH1 108 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 PDGFRBP09619 1106 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 LMO2P25791 158 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CREMQ03060 361 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF394Q53GI3 561 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 FAM71AQ8IYT1 594 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 MTRRQ9UBK8 725 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 HMGXB4Q9UGU5 601 aa29.62■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 OR6C75A6NL08 312 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC53A6NM62 1247 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 C2CD2LO14523 706 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 GRM6O15303 877 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CNGA4Q8IV77 575 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM176AQ96HP8 235 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 TCF25Q9BQ70 676 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 RTP3Q9BQQ7 232 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF576Q9H609 170 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 PAEPP09466 180 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 KRT9P35527 623 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 TSPY1Q01534 308 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 SPC24Q8NBT2 197 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 TWNKQ96RR1 684 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 SYT15Q9BQS2 421 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 NME7Q9Y5B8 376 aa29.6■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC172P0C7W6 258 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF132P52740 706 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 RAD23BP54727 409 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CRYBG2Q8N1P7 616 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 IRAK3Q9Y616 596 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CHD9Q3L8U1 2897 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 HCRTO43612 131 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 MFAP3LO75121 409 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJB1P25685 340 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CA8P35219 290 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 BPIFB4P59827 614 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN14Q15678 1187 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 SFMBT2Q5VUG0 894 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 SLC4A11Q8NBS3 891 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 OR10T2Q8NGX3 314 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D4O60343 1298 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 LPXNO60711 386 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 GFPT2O94808 682 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CXCL14O95715 111 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ERVFC1P60507 584 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 PTK2Q05397 1052 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 ACOT1Q86TX2 421 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 DPEP3Q9H4B8 488 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 FNIP2Q9P278 1114 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-201ENST00000345425 CYP26A1O43174 497 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 FERP16591 822 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ORC1Q13415 861 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 AIPL1Q9NZN9 384 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1257Q9ULG3 409 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 FSCN2O14926 492 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 LILRB3O75022 631 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CLCN1P35523 988 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 SLC8B1Q6J4K2 584 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR8K1Q8NGG5 319 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 AUTS2Q8WXX7 1259 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 RXFP1Q9HBX9 757 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CDY1Q9Y6F8 540 aa29.57■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ADKP55263 362 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 CAMK1Q14012 370 aa29.56■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 PLPP4Q5VZY2 271 aa29.56■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC7Q99615 494 aa29.56■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 EPOPA6NHQ4 379 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 GNA15P30679 374 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ARID5AQ03989 594 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ARID5BQ14865 1188 aa29.55■■■□□ 2.32
GIPC1-201ENST00000345425 ASIC2Q16515 512 aa29.55■■■□□ 2.32
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