RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 TNMDQ9H2S6 317 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM206Q9H813 350 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 KPNA7A9QM74 516 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 CUTAO60888 179 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 YEATS4O95619 227 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 VIPR2P41587 438 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 WNT7BP56706 349 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 BCO2Q9BYV7 579 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 GPR88Q9GZN0 384 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ASB3Q9Y575 518 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 EXTL3O43909 919 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ITGB3P05106 788 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 GDI1P31150 447 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 VITQ6UXI7 678 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ITIH5Q86UX2 942 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 TMC8Q8IU68 726 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 HPS3Q969F9 1004 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC3Q9BY71 257 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 CUEDC2Q9H467 287 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.6■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 PSMC3P17980 439 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 PNPLA4P41247 253 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ASIC1P78348 528 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 AMPD3Q01432 767 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 E2F4Q16254 413 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 IQUBQ8NA54 791 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 DNASE1L2Q92874 299 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 IRF7Q92985 503 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 PSMG2Q969U7 264 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 BORCS6Q96GS4 357 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 KRT19P08727 400 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 BFSP1Q12934 665 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 VEPH1Q14D04 833 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 TAF12Q16514 161 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 SHC4Q6S5L8 630 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 GPD1LQ8N335 351 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 FAM84AQ96KN4 292 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 NELL2Q99435 816 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM9Q9C026 710 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 R4GN57 208 aa22.58■■□□□ 1.21
PPP4C-211ENST00000567642 COL4A2P08572 1712 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF263O14978 683 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 NCAM2O15394 837 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 FGF19O95750 216 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 F13A1P00488 732 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SP9P0CG40 484 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 GABRR2P28476 465 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 YAF2Q8IY57 180 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 GIPC2Q8TF65 315 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PPP4C-211ENST00000567642 LAMTOR5O43504 91 aa22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms