RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBED6P86452 979 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 UNC93AQ86WB7 457 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 SPAG5Q96R06 1193 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 SOD2P04179 222 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 TPM1P09493 284 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 CTNNB1P35222 781 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 ARID5BQ14865 1188 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 USP41Q3LFD5 358 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJB2P25686 324 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TKTP29401 623 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CASP14P31944 242 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 RAP1GAPP47736 663 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE3AQ05086 875 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 METTL23Q86XA0 190 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 DRC7Q8IY82 874 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TTPALQ9BTX7 342 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF132P52740 706 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CNGA4Q8IV77 575 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 WHAMMQ8TF30 809 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CD58P19256 250 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SOX5P35711 763 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 STAT1P42224 750 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PDXDC1Q6P996 788 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX25Q9H3E2 840 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 MFAP3LO75121 409 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 KRT9P35527 623 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 NDST1P52848 882 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 DSG1Q02413 1049 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM270Q6UE05 265 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAJC7Q99615 494 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 ACBD6Q9BR61 282 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 VWA8A3KMH1 1905 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC53A6NM62 1247 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PAEPP09466 180 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 PCSK1P29120 753 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 RTP2Q5QGT7 225 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SPRED2Q7Z698 418 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 OSTM1Q86WC4 334 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS52Q8N1B4 723 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TIFAQ96CG3 184 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 RTP3Q9BQQ7 232 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 NME7Q9Y5B8 376 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TSC2P49815 1807 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 A8MXQ7 604 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 H7C4K7 107 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TBC1D4O60343 1298 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 RAD23BP54727 409 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 CEP57Q86XR8 500 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 TNIP3Q96KP6 325 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-205ENST00000528462 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.47■■□□□ 1.35
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