RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	NFU1	Q9UMS0	254 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	KIF14	Q15058	1648 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	RERE	Q9P2R6	1566 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163		A8MZ25	164 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	SCD	O00767	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ADCY6	O43306	1168 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	GJB1	P08034	283 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	GLDC	P23378	1020 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ADM	P35318	185 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CR1L	Q2VPA4	569 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	STRA6	Q9BX79	667 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ITPA	Q9BY32	194 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	TBX20	Q9UMR3	447 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	DEPDC5	O75140	1603 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	THAP12	O43422	761 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	DNTT	P04053	509 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	GSTM1	P09488	218 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ACSL1	P33121	698 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	DLK2	Q6UY11	383 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF365	Q70YC5	407 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CCT6B	Q92526	530 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	RTKN	Q9BST9	563 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	RAD18	Q9NS91	495 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	VAV3	Q9UKW4	847 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	PLXNC1	O60486	1568 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	PJA2	O43164	708 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	IL18BP	O95998	194 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CHEK2	O96017	543 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	SYP	P08247	313 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	DRD2	P14416	443 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CD86	P42081	329 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	MRE11	P49959	708 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	JAG1	P78504	1218 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	MAPK7	Q13164	816 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	NFYC	Q13952	458 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	CCNG2	Q16589	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	EXD3	Q8N9H8	876 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	OR7D4	Q8NG98	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	KAT5	Q92993	513 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM5	Q9C035	493 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	WIPF1	O43516	503 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	LY86	O95711	162 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	IGFBP2	P18065	325 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	AP2B1	P63010	937 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	TRPC3	Q13507	836 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	ACAP2	Q15057	778 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBXN4-208	ENST00000490163	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		3.35	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms