RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443253.1

BBX-212, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 5

Gene BBX, Length 238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-212ENST00000443253 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.14□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.14□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CCDC78A2IDD5 438 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PROB1E7EW31 1015 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 E9PLN8 166 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TBX3O15119 743 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ZNF185O15231 689 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ANXA1P04083 346 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CKBP12277 381 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 FCER1AP12319 257 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CD38P28907 300 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 UBE4AQ14139 1066 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 KRT78Q8N1N4 520 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SVIPQ8NHG7 77 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SCAMP4Q969E2 229 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TLR10Q9BXR5 811 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TEX101Q9BY14 249 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 GPR35Q9HC97 309 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 MED16Q9Y2X0 877 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 AHRRA9YTQ3 701 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ISM1B1AKI9 464 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 DNAJB5O75953 348 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 GNAI2P04899 355 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 MYL3P08590 195 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 KCNJ5P48544 419 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 RHBDL3P58872 404 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SLC25A3Q00325 362 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 FMO1Q01740 532 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PICALMQ13492 652 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CNGA2Q16280 664 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 USP37Q86T82 979 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PDPRQ8NCN5 879 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 FBXO41Q8TF61 875 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SLC39A13Q96H72 371 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 STK32BQ9NY57 414 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 CDYLQ9Y232 598 aa4.12□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ZAR1LA6NP61 321 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 DIRC3C9JPN6 131 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 M0QYG6 137 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TRIM24O15164 1050 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 UNC5CO95185 931 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ABHD16AO95870 558 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 BRAFP15056 766 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 FGFR4P22455 802 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PIK3CBP42338 1070 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 RABL3Q5HYI8 236 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 MAML1Q92585 1016 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 PHKBQ93100 1093 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 TBCBQ99426 244 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 DPH1Q9BZG8 443 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.11□□□□□ -1.75
BBX-212ENST00000443253 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms