RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 WDR59Q6PJI9 974 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM270Q6UE05 265 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 HASPINQ8TF76 798 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 IGSF21Q96ID5 467 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 PTPRDP23468 1912 aa14.53□□□□□ -0.08
PRPF18-201ENST00000320054 CYP26A1O43174 497 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PAEPP09466 180 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 LINC00271P0C7V0 271 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PPM1AP35813 382 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 USP8P40818 1118 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 LHX1P48742 406 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 NDST1P52848 882 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PTK2Q05397 1052 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 WSCD1Q658N2 575 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 HGSNATQ68CP4 663 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 FUT10Q6P4F1 479 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 METTL23Q86XA0 190 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 WHAMMQ8TF30 809 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 SNX25Q9H3E2 840 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 SPG21Q9NZD8 308 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 STK39Q9UEW8 545 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.52□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 I3L4J1 428 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 FGFR3P22607 806 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 ANXA13P27216 316 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PBX3P40426 434 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 RAD23BP54727 409 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 OSTM1Q86WC4 334 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM139Q8IV31 216 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.51□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 A8MXQ7 604 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 NRDCO43847 1150 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 OAZ2O95190 189 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 CYP11B1P15538 503 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 ARID5AQ03989 594 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF677Q86XU0 584 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM169Q96HH4 297 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TNIP3Q96KP6 325 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TWNKQ96RR1 684 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 SYT11Q9BT88 431 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 NME7Q9Y5B8 376 aa14.5□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 LCHNA4D1U4 455 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 LINC01553A4QN01 128 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 VDRP11473 427 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 SKILP12757 684 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PCSK1P29120 753 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 GNA15P30679 374 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PDE6CP51160 858 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 RABGGTBP53611 331 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 CCZ1BP86790 482 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 PLCB3Q01970 1234 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF394Q53GI3 561 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 HS1BP3Q53T59 392 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.49□□□□□ -0.09
PRPF18-201ENST00000320054 GPR65Q8IYL9 337 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms