RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX21Q9UL17 535 aa26.6■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP10Q9Y6W6 482 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 INPPL1O15357 1258 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 GNA15P30679 374 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT8Q92599 483 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 APBB2Q92870 758 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 INTUQ9ULD6 942 aa26.6■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 SCLYQ96I15 445 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 MMS19Q96T76 1030 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa26.59■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 CILPO75339 1184 aa26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 SYT10Q6XYQ8 523 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC39CQ8N584 583 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 WHAMMQ8TF30 809 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 ISCUQ9H1K1 167 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 GDAP2Q9NXN4 497 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R14Q9NYV8 317 aa26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ENPP3O14638 875 aa26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2C18P33260 490 aa26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF394Q53GI3 561 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 H2AFVQ71UI9 128 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAAF5Q86Y56 855 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 BTNL10A8MVZ5 291 aa26.56■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 CLTBP09497 229 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD23BP54727 409 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 GALCP54803 685 aa26.56■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 TCTN1Q2MV58 587 aa26.56■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF606Q8WXB4 792 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMCO5BA8MYB1 307 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP12O43422 761 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 RTN2O75298 545 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 POMCP01189 267 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 LILRA4P59901 499 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR24Q96S15 920 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF569Q5MCW4 686 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC4A11Q8NBS3 891 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 ELOVL4Q9GZR5 314 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa26.55■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF592Q92610 1267 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM176AQ96HP8 235 aa26.54■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD62A6NC57 917 aa26.53■■□□□ 1.84
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CAPNS1-215ENST00000628018 CFHP08603 1231 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 NDST1P52848 882 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 UPP1Q16831 310 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 CLLU1OSQ5K130 101 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF18AQ8NI77 898 aa26.53■■□□□ 1.84
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