RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493315.1

WDPCP-217, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDPCP, Length 1,476 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-217ENST00000493315 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NRCAMQ92823 1304 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 A6NJR5 290 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SIAH2O43255 324 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 THAP12O43422 761 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CEP104O60308 925 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 KRT19P08727 400 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 STAG3L1P0CL83 205 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CXCL8P10145 99 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MYBL1P10243 752 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CYP2C19P33261 490 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MYL6P60660 151 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 VSNL1P62760 191 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TCEAL1Q15170 157 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CLUL1Q15846 466 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 LIN9Q5TKA1 542 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 WDR93Q6P2C0 686 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CPB2Q96IY4 423 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NUP85Q9BW27 656 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ACP6Q9NPH0 428 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SETD4Q9NVD3 440 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.29□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 LACTBL1A8MY62 500 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GPR25O00155 361 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ADCY6O43306 1168 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TSPAN1O60635 241 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MTA2O94776 668 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 F2P00734 622 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CYP1A2P05177 515 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CYP2C9P11712 490 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MESDQ14696 234 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CCL14Q16627 93 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 AMHR2Q16671 573 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 KIZQ2M2Z5 673 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 KRT222Q8N1A0 295 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CEP120Q8N960 986 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 USP38Q8NB14 1042 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 USP6NLQ92738 828 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 HES6Q96HZ4 224 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ASB7Q9H672 318 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 GINS2Q9Y248 185 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 Q9Y3F1 56 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 PASKQ96RG2 1323 aa8.28□□□□□ -1.08
WDPCP-217ENST00000493315 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 SPOPO43791 374 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 CALCAP01258 141 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 IQCF3P0C7M6 154 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 GNAT1P11488 350 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 P4HA1P13674 534 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 AKR1A1P14550 325 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 CD58P19256 250 aa8.27□□□□□ -1.09
WDPCP-217ENST00000493315 ATICP31939 592 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms