RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 SLC34A1Q06495 639 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PPM1KQ8N3J5 372 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KAT5Q92993 513 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ART4Q93070 314 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NUP85Q9BW27 656 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PLVAPQ9BX97 442 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SLC16A4O15374 487 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 GSTA2P09210 222 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRKCIP41743 596 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DRG2P55039 364 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KDSRQ06136 332 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PRKG1Q13976 671 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 OR52E8Q6IFG1 317 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD5Q6N075 450 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RHOT2Q8IXI1 618 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FAM151AQ8WW52 585 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MAML1Q92585 1016 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SNF8Q96H20 258 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PLSCR1O15162 318 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC22O60826 627 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 USP1O94782 785 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SETSIPP0DME0 302 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNB2P17787 502 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PEX3P56589 373 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MTMR2Q13614 643 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FAM102BQ5T8I3 360 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FOXB2Q5VYV0 432 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SLC5A5Q92911 643 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CENPKQ9BS16 269 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 EMSYQ7Z589 1322 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 E7ENQ6 273 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 STK10O94804 968 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 MAP7Q14244 749 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TTLL6Q8N841 843 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CEP70Q8NHQ1 597 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 WDR60Q8WVS4 1066 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 AGPAT1Q99943 283 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ASB3Q9Y575 518 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FAM200BP0CF97 657 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 GAP43P17677 238 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 STK33Q9BYT3 514 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ARL8BQ9NVJ2 186 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CIB2O75838 187 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PSMG1O95456 288 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 USP46P62068 366 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PPATQ06203 517 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 IZUMO3Q5VZ72 239 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 NRG4Q8WWG1 115 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 A6NJR5 290 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 H3BRJ5 948 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ENO1P06733 434 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 T-ENOLP0DO92 83 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CAP2P40123 477 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CCNG1P51959 295 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CNPY1Q3B7I2 92 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ANKMY2Q8IV38 441 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 INPP5DQ92835 1189 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 HAUS1Q96CS2 278 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TAAR1Q96RJ0 339 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TUFT1Q9NNX1 390 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 DPEP1P16444 411 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RASA3Q14644 834 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 C7orf43Q8WVR3 580 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TTC17Q96AE7 1141 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 FNBP1Q96RU3 617 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 THTPAQ9BU02 230 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 EHMT1Q9H9B1 1298 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ETNK2Q9NVF9 386 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL11Q9NVR0 708 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 PCYOX1Q9UHG3 505 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.11■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 B2RBV5 119 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CYP3A4P08684 503 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 KITP10721 976 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BCRP11274 1271 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 COG7P83436 770 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 CLUL1Q15846 466 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 EPC2Q52LR7 807 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 OTOAQ7RTW8 1153 aa17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
CCSAP-204ENST00000483092 BORCS6Q96GS4 357 aa17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms