RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529417.1

AP001999.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP001999.2, Length 389 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001999.2-201ENST00000529417 DAG1Q14118 895 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ARHGEF6Q15052 776 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 NR0B2Q15466 257 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ADRM1Q16186 407 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 GAB4Q2WGN9 574 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CFAP161Q6P656 301 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 LYPD4Q6UWN0 246 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 RFX8Q6ZV50 586 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 MOB2Q70IA6 237 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TMC6Q7Z403 805 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ASB15Q8WXK1 588 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 DPF2Q92785 391 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CDCA5Q96FF9 252 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 NT5C1BQ96P26 610 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 RASSF1Q9NS23 344 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 LRFN1Q9P244 771 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 MYOTQ9UBF9 498 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PRSS50Q9UI38 385 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CGNL1Q0VF96 1302 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 SSC5DA1L4H1 1573 aa4.85□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ZNF462Q96JM2 2506 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 MYPNQ86TC9 1320 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 C9orf172C9J069 976 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 THP07101 528 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PFKMP08237 780 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 SLURP2P0DP57 97 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TSHRP16473 764 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 NOS3P29474 1203 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 WASP42768 502 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 HSPA7P48741 367 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ALDH9A1P49189 494 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ARL4CP56559 192 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 FKBP1BP68106 108 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TEKQ02763 1124 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CRHR2Q13324 411 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 MYBPC3Q14896 1274 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 EMC4Q5J8M3 183 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ICE2Q659A1 982 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PRR5LQ6MZQ0 368 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 RETSATQ6NUM9 610 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ZAR1Q86SH2 424 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CABP7Q86V35 215 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ZNF566Q969W8 418 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ERP27Q96DN0 273 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 SLC35A4Q96G79 324 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 NACC1Q96RE7 527 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 GREM2Q9H772 168 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.84□□□□□ -1.63
AP001999.2-201ENST00000529417 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms