RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNKPQ96T60 521 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLR10Q9BXR5 811 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYBUQ9NX95 663 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLHQ9Y253 713 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.93□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E2F8A0AVK6 867 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MASP2O00187 686 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC16A6O15403 523 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTNBO60941 627 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP2K6P52564 334 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHB1P54762 984 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOGQ13253 232 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP2A13Q16696 494 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6YL49 198 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMIEQ8NEW7 156 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGMAQ96B86 450 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF31Q96EP0 1072 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MVB12AQ96EY5 273 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED15Q96RN5 788 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.92□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B3GALT2O43825 422 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOSP01100 380 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMARCA1P28370 1054 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRDX5P30044 214 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP2C19P33261 490 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP10-9P60411 292 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MXRA7P84157 204 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAP1Q03518 808 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGS1Q32NB8 556 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR149Q86SP6 731 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDH19Q9H159 772 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF181Q9P0P0 153 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.91□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYADML2A6NDP7 307 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARIH2O95376 493 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC93Q567U6 631 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZAR1LA6NP61 321 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 E9PLN8 166 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFPL1O75677 317 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANXA1P04083 346 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TYRP14679 529 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAV2P52735 878 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GEN1Q17RS7 908 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ODR4Q5SWX8 454 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDSS2Q86YH6 399 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPH2Q8IWU9 490 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDPRQ8NCN5 879 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COQ10AQ96MF6 247 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TOR3AQ9H497 397 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDCPQ9H6R7 721 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCF2Q9UG63 623 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDYLQ9Y232 598 aa5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PS29 197 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALDH2P05091 517 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GJB1P08034 283 aa5.88□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGAMP11215 1152 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms