RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 SPAG1Q07617 926 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 DPYDQ12882 1025 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 UPP1Q16831 310 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.17■□□□□ 0.82
SYP-205ENST00000472598 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.17■□□□□ 0.82
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SYP-205ENST00000472598 SRFP11831 508 aa20.11■□□□□ 0.81
SYP-205ENST00000472598 PSMD2Q13200 908 aa20.11■□□□□ 0.81
SYP-205ENST00000472598 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.11■□□□□ 0.81
SYP-205ENST00000472598 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYP-205ENST00000472598 FGF13Q92913 245 aa20.11■□□□□ 0.81
SYP-205ENST00000472598 CDH7Q9ULB5 785 aa20.11■□□□□ 0.81
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