RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-552P-201ENST00000362869 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYADML2A6NDP7 307 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKAP10O43572 662 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 OFD1O75665 1012 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFPL1O95159 310 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA1P04083 346 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGM1P22735 817 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2C19P33261 490 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3CGP48736 1102 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB27AP51159 221 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 VAV2P52735 878 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 HK3P52790 923 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAPQ12770 1279 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GEN1Q17RS7 908 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC157Q569K6 752 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR149Q86SP6 731 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDSS2Q86YH6 399 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDPRQ8NCN5 879 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 NACC2Q96BF6 587 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MVB12AQ96EY5 273 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 COQ10AQ96MF6 247 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGAP2Q99490 1192 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K14Q99558 947 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDCPQ9H6R7 721 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRD9Q9H8M2 597 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLAMF7Q9NQ25 335 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RLIMQ9NVW2 624 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYBUQ9NX95 663 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL4A3Q01955 1670 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF785A8K8V0 405 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF10O60809 474 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJB1P08034 283 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNA2P16389 499 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDX5P30044 214 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP2K6P52564 334 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPP3Q13368 585 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAMP4Q969E2 229 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 HPS3Q969F9 1004 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM167AQ96KS9 214 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q96MF0 132 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf43Q9BWL3 253 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH19Q9H159 772 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CASS4Q9NQ75 786 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PS29 197 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOR1BO14657 336 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUV39H1O43463 412 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHEK2O96017 543 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TYRP14679 529 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROZP22891 400 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL12RB1P42701 662 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC24CP53992 1094 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 INHBEP58166 350 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATAT1Q5SQI0 421 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAPT1Q6NXT6 567 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2D3CQ8N5H7 860 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q8NA96 180 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSH3Q8TE77 659 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 AIFM3Q96NN9 605 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIB1Q96RU8 372 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMOQ99835 787 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR35Q9HC97 309 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf21Q9P2W6 132 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms