RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MEIS3P2A8K0S8 358 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAD21O60216 631 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHRM2P08172 466 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFV1P49821 464 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ID2Q02363 134 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF91Q05481 1191 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRIK2Q13002 908 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NFATC2Q13469 925 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SHBQ15464 509 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C9orf57Q5W0N0 161 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTBD8Q5XKL5 378 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF774Q6NX45 483 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FANCBQ8NB91 859 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC25A28Q96A46 364 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RTP4Q96DX8 246 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHF21BQ96EK2 531 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JAM3Q9BX67 310 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BARHL1Q9BZE3 327 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNPEPQ9H4A4 650 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRDM8Q9NQV8 689 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM86C1Q9NVL1 165 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UCKL1Q9NWZ5 548 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTMR7Q9Y216 660 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF215Q9Y6U7 377 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TNXBP22105 4242 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACACBO00763 2458 aa-0.41□□□□□ -2.47
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EBLN1P0CF75 366 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSD17B4P51659 736 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 XGP55808 180 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TESK1Q15569 626 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRTGQ2VWP7 1150 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STPG1Q5TH74 334 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF804AQ7Z570 1209 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF547Q8IVP9 402 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CALML6Q8TD86 181 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBF1Q8TES7 1133 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SSH1Q8WYL5 1049 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCMH1Q96GD3 660 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR92Q96MX6 357 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZSWIM1Q9BR11 485 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RIC8BQ9NVN3 520 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR27A2RRH5 827 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B5MCH6 92 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LMX1BO60663 402 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R3DO95685 299 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPANK1O95872 356 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGF2P09038 288 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD48P09326 243 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GNAT1P11488 350 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CEBPBP17676 345 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EN2P19622 333 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGFR4P22455 802 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCSK6P29122 969 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHN2P52757 468 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HERVK_113P62684 666 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MANEAQ5SRI9 462 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSHZ3Q63HK5 1081 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXR2Q6PJQ5 311 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF813Q6ZN06 617 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C16orf82Q7Z2V1 217 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MARCH9Q86YJ5 346 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERC1Q8IUD2 1116 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIR2DL5AQ8N109 375 aa-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms