RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624951.1

CU633980.2-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CU633980.2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.2-201ENST00000624951 SOD2P04179 222 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 CCDC192P0DO97 292 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 VAMP7P51809 220 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 CCDC40Q4G0X9 1142 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 FRMD5Q7Z6J6 570 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 C3orf58Q8NDZ4 430 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 OR5B17Q8NGF7 314 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 HASPINQ8TF76 798 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 BORCS6Q96GS4 357 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 ZNF560Q96MR9 790 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 GUCD1Q96NT3 240 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 VN1R3Q9BXE9 311 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.21□□□□□ -0.45
CU633980.2-201ENST00000624951 SCN1AP35498 2009 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 FSCN2O14926 492 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ITGB3P05106 788 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 DNAJB1P25685 340 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 GTF2H1P32780 548 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 PNPLA4P41247 253 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 RBP5P82980 135 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 CAMK1Q14012 370 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TIGD5Q53EQ6 642 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 CD300LGQ6UXG3 332 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 VPS52Q8N1B4 723 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TMEM130Q8N3G9 435 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 LRRC52Q8N7C0 313 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 FAM84AQ96KN4 292 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 MED15Q96RN5 788 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 GPR62Q9BZJ7 368 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ZBP1Q9H171 429 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SIX4Q9UIU6 781 aa12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 VWA8A3KMH1 1905 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SYCE3A1L190 88 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 PPEF2O14830 753 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 URODP06132 367 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 KRT19P08727 400 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TRIM49P0CI25 452 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TRIM49CP0CI26 452 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 CTSAP10619 480 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 FOSL2P15408 326 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 GLUD2P49448 558 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TAF6P49848 677 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 MARSP56192 900 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 LILRA4P59901 499 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 DLG4P78352 724 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 BIRC3Q13489 604 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ADGRE1Q14246 886 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 USP41Q3LFD5 358 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ZACNQ401N2 412 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SV2CQ496J9 727 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TMC7Q7Z402 723 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 FAM114A1Q8IWE2 563 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 GPR65Q8IYL9 337 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 CXorf38Q8TB03 319 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 MYLIPQ8WY64 445 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 ZNF516Q92618 1163 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SUSD3Q96L08 255 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TCF25Q9BQ70 676 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 THAP9Q9H5L6 903 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 AGAP1Q9UPQ3 857 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 MTCH2Q9Y6C9 303 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 MYO7AQ13402 2215 aa12.19□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 TSC2P49815 1807 aa12.18□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 M0QZQ0 153 aa12.18□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 SYN3O14994 580 aa12.18□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 PHACTR2O75167 634 aa12.18□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CU633980.2-201ENST00000624951 FGFR3P22607 806 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms