RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-210	ENST00000549362	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ZNF609	O15014	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MST1R	Q04912	1400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362		E7EWF7	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	EYA2	O00167	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	GOLIM4	O00461	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ZNF213	O14771	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SERPINC1	P01008	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	HPX	P02790	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CYBB	P04839	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MPO	P05164	745 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TUBB	P07437	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	DBH	P09172	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	OSM	P13725	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MTHFD2	P13995	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	PHKG2	P15735	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	FAH	P16930	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	PDE6B	P35913	854 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SLC5A3	P53794	718 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	HTRA3	P83110	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CCZ1B	P86790	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NR1I3	Q14994	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ASB15	Q8WXK1	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	JADE3	Q92613	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	ACOT7	O00154	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP25-210	ENST00000549362	MAFG	O15525	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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