RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF677Q86XU0 584 aa24.81■■□□□ 1.56
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FAAP20-209ENST00000428120 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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FAAP20-209ENST00000428120 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-209ENST00000428120 CISHQ9NSE2 258 aa24.79■■□□□ 1.56
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FAAP20-209ENST00000428120 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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FAAP20-209ENST00000428120 RGMBQ6NW40 437 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-209ENST00000428120 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-209ENST00000428120 KAT2BQ92831 832 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-209ENST00000428120 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-209ENST00000428120 SIX4Q9UIU6 781 aa24.77■■□□□ 1.56
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.76■■□□□ 1.56
FAAP20-209ENST00000428120 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 IL18RAPO95256 599 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 RAP1GAPP47736 663 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 NOMO3P69849 1222 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 IFNL1Q8IU54 200 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 H3BQF6 201 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 C17orf99Q6UX52 265 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 MON1BQ7L1V2 547 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 RUBCNQ92622 972 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-209ENST00000428120 BRCA2P51587 3418 aa24.75■■□□□ 1.55
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