RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 RPL17P18621 184 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PLA2G5P39877 138 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 RTP2Q5QGT7 225 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PALB2Q86YC2 1186 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PCIF1Q9H4Z3 704 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIP11Q15643 1979 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 DENND4AQ7Z401 1863 aa29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM221A6NGB7 291 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 M0R296 226 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SMC2O95347 1197 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ARMCX5Q6P1M9 558 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SMARCE1Q969G3 411 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SAAL1Q96ER3 474 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GSDMAQ96QA5 445 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CITO14578 2027 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 LACTBL1A8MY62 500 aa29.49■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GLUD1P00367 558 aa29.49■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM122AQ96E09 287 aa29.49■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 RMND1Q9NWS8 449 aa29.49■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO10Q9HD67 2058 aa29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 RFPL2O75678 378 aa29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM213AQ9BRX8 229 aa29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 KCTD10Q9H3F6 313 aa29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA8IPA6NC78 632 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA8JA6NMD2 632 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CLIC2O15247 247 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 TGM5O43548 720 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 LDHAP00338 332 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP2R3AQ06190 1150 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SPAG1Q07617 926 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SIGLEC14Q08ET2 396 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 KREMEN2Q8NCW0 462 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PBXIP1Q96AQ6 731 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SMOC2Q9H3U7 446 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 HSPBP1Q9NZL4 362 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FNIP2Q9P278 1114 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 EXTL3O43909 919 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ASGR2P07307 311 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP57Q86XR8 500 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GPR65Q8IYL9 337 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM212AQ96EL1 285 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ASIC4Q96FT7 647 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 LIMD1Q9UGP4 676 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF318Q5VUA4 2279 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB6Q15916 424 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 LILRA6Q6PI73 481 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CD300LGQ6UXG3 332 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CD302Q8IX05 232 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 C12orf56Q8IXR9 622 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GPD1LQ8N335 351 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 TTPALQ9BTX7 342 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC38A7Q9NVC3 462 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 USTQ9Y2C2 406 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-202ENST00000392919 VWA8A3KMH1 1905 aa29.45■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CLCNKBP51801 687 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC149Q6ZUS6 474 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 BRSK2Q8IWQ3 736 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF12Q96FN5 646 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 MFSD14AQ96MC6 490 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CLSTN3Q9BQT9 956 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 SORCS3Q9UPU3 1222 aa29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA6L22H0YM25 854 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 PDXKO00764 312 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF20AO95235 890 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP2J2P51589 502 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 WNT7BP56706 349 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 CAMK4Q16566 473 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 JADE1Q6IE81 842 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM130Q8N3G9 435 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-202ENST00000392919 C3orf58Q8NDZ4 430 aa29.43■■■□□ 2.3
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