RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYND10O75800 440 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D8O95759 1140 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 KRT19P08727 400 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2C9P11712 490 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 NUP85Q9BW27 656 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ALG6Q9Y672 507 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ANK1P16157 1881 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 KAT6AQ92794 2004 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 HAS3O00219 553 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CA12O43570 354 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 NAA35Q5VZE5 725 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 PASD1Q8IV76 773 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 HINFPQ9BQA5 517 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 SIX4Q9UIU6 781 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 MGAMO43451 1857 aa24.34■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 MTA2O94776 668 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 WEE2P0C1S8 567 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF132P52740 706 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 USP38Q8NB14 1042 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 TRPV1Q8NER1 839 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD6Q96KE9 485 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 OSMRQ99650 979 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CISHQ9NSE2 258 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 Q9Y3F1 56 aa24.33■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 THAP12O43422 761 aa24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TUBBP07437 444 aa24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ASPAP45381 313 aa24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM17P78536 824 aa24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 MESDQ14696 234 aa24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF394Q53GI3 561 aa24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TREHO43280 583 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 C2CD6Q53TS8 623 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 POLIQ9UNA4 740 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ASB7Q9H672 318 aa24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 MYADML2A6NDP7 307 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 SASH3O75995 380 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ITGB3P05106 788 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 AKR1A1P14550 325 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 PSMC4P43686 418 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 SLC7A5Q01650 507 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CENPCQ03188 943 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ACAP3Q96P50 834 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 GABRQQ9UN88 632 aa24.31■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ERLIN1O75477 346 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf38Q8TB03 319 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 NPTXRO95502 500 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 COMTP21964 271 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 RRM1P23921 792 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 NOMO3P69849 1222 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 KYAT1Q16773 422 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 LLGL2Q6P1M3 1020 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.3■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 RAP1GAPP47736 663 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 GUCY2FP51841 1108 aa24.29■■□□□ 1.48
VSTM4-201ENST00000298454 FCGRTP55899 365 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms