RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 NOMO1Q15155 1222 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 FCRLBQ6BAA4 426 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 TIMP4Q99727 224 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 BCO1Q9HAY6 547 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 CDHR4A6H8M9 788 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 RFPL3O75679 317 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 CKBP12277 381 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 GRIA3P42263 894 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 LSSP48449 732 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 PDCD1Q15116 288 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 SOGA3Q5TF21 947 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 RASAL3Q86YV0 1011 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 GPR156Q8NFN8 814 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 SLC5A5Q92911 643 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-210ENST00000487548 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 LINC00473A8K010 186 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 IL2RBP14784 551 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 PTGER1P34995 402 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 FAM153CQ494X1 144 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 LPIN2Q92539 896 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 HAPLN3Q96S86 360 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 PNKPQ96T60 521 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 EMC7Q9NPA0 242 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 LANCL2Q9NS86 450 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.15□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CCDC151A5D8V7 595 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 ADM5C9JUS6 153 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 KELP23276 732 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 LLGL1Q15334 1064 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 VWA1Q6PCB0 445 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 PADI4Q9UM07 663 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 AOX1Q06278 1338 aa4.14□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 MPPED1O15442 326 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 FCER1AP12319 257 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 PCSK1P29120 753 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 MPGP29372 298 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TUBA4AP68366 448 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 RASSF3Q86WH2 238 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 FITM2Q8N6M3 262 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TMEM140Q9NV12 185 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TMEM260Q9NX78 707 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CDYLQ9Y232 598 aa4.13□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 LINC01548A6NM66 108 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 E9PSI1 815 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 ALAS1P13196 640 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 FPGSQ05932 587 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 SLFN5Q08AF3 891 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 NFE2L2Q16236 605 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 KLHL22Q53GT1 634 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 TSPEARQ8WU66 669 aa4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SENP6-210ENST00000487548 SH2D3AQ9BRG2 576 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms