RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 METRNLQ641Q3 311 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 B3GNT9Q6UX72 402 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF365Q70YC5 407 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 TPH2Q8IWU9 490 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYO1HQ8N1T3 1032 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 RNF169Q8NCN4 708 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 CPT1CQ8TCG5 803 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 STON2Q8WXE9 905 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 EXTL1Q92935 676 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 LENG9Q96B70 501 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 RUNDC1Q96C34 613 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF503Q96F45 646 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 TAAR9Q96RI9 348 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 MED15Q96RN5 788 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SIK2Q9H0K1 926 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 RNPEPQ9H4A4 650 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRDM11Q9NQV5 511 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 LMBRD1Q9NUN5 540 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 CFAP97Q9P2B7 532 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SORCS3Q9UPU3 1222 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 MARCH11A6NNE9 402 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 F2RL2O00254 374 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 WNT10BO00744 389 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ITGB1P05556 798 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 TYRP14679 529 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRDX5P30044 214 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 BMPR1AP36894 532 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PIK3CGP48736 1102 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 CHN2P52757 468 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 GPSM2P81274 684 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PIGFQ07326 219 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SNAPC2Q13487 334 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 TUBA3CQ13748 450 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 GBX1Q14549 363 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 KIF22Q14807 665 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 LRRC41Q15345 812 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANO6Q4KMQ2 910 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCDC93Q567U6 631 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCDC157Q569K6 752 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 EMC10Q5UCC4 262 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 TUBA3EQ6PEY2 450 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 LRRC55Q6ZSA7 311 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 MED25Q71SY5 747 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM90A1Q86YD7 464 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SYT12Q8IV01 421 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZFPM1Q8IX07 1006 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SYNE4Q8N205 404 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM43AQ8N2R8 423 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF276Q8N554 614 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 CAMKK1Q8N5S9 505 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 OR56A1Q8NGH5 318 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 KLHDC4Q8TBB5 520 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 SCAMP4Q969E2 229 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PGBD4Q96DM1 585 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYEOVQ96EZ4 313 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 C8orf48Q96LL4 319 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PNKPQ96T60 521 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 CGRRF1Q99675 332 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYOCQ99972 504 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM60Q9H2L4 133 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 GSTO2Q9H4Y5 243 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM204AQ9H8W3 233 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANLNQ9NQW6 1124 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 KLHL11Q9NVR0 708 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PNPOQ9NVS9 261 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FBXO34Q9NWN3 711 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 GABBR1Q9UBS5 961 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABCF2Q9UG63 623 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCNE5Q9UJ90 142 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FZD1Q9UP38 647 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A088AWK7 358 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-57P-201ENST00000411348 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDHR4A6H8M9 788 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-57P-201ENST00000411348 AHRRA9YTQ3 701 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms