RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041055.8

Atg2b-201, Transcript of Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg2b, Length 7,546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Aox3G3X982 1335 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zfp558E9Q1J0 407 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Usp8Q80U87 1080 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Med21Q9CQ39 144 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm8113E0CXS8 587 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Hipk4Q3V016 616 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prkaa1Q5EG47 559 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Mief2Q5NCS9 454 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Acap2Q6ZQK5 770 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Them6Q80ZW2 207 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pdk1Q8BFP9 434 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Haus3Q8QZX2 570 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Atp5hQ9DCX2 161 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 SufuQ9Z0P7 484 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Wdr41Q3UDP0 460 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Snx30Q8CE50 437 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa13.14□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm3424L7N298 263 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm8246M0QWX9 263 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Npy5rO70342 466 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 DtnbO70585 659 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PltpP55065 493 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Grin2dQ03391 1323 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 4933427I04RikQ3V053 235 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dennd2cQ6P9P8 914 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tlr11Q6R5P0 926 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zmym6Q8BS54 1249 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Nr3c2Q8VII8 978 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 XpotQ9CRT8 963 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Znf521Q6KAS7 1311 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm1758F6VZZ1 202 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Parp14Q2EMV9 1817 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lcn6A2AJB9 181 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Serpinb9O08797 374 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 GclmO09172 274 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Cd19P25918 547 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Kcnn2P58390 839 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Baiap2l2Q80Y61 522 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Krt75Q8BGZ7 551 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Reep2Q8VCD6 254 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pdcd7Q9WTY1 482 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm28360A0A087WR25 190 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc2a4P14142 509 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 9130409I23RikQ3TS87 320 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Smcr8Q3UMB5 935 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Bpifb6Q8BU51 449 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 ScgnQ91WD9 276 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dach2Q925Q8 634 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Hcn2O88703 863 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 PdgfraP26618 1089 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Afg1lQ3V384 480 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Grm4Q68EF4 912 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Trpc7Q9WVC5 862 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tp53P02340 387 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 RargP18911 458 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Prr7Q3V0I2 269 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lrrc8eQ66JT1 795 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Olfr119Q7TRJ5 321 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Actl9Q8CG27 415 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Snx9Q91VH2 595 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa13.13□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rhox3cA2AWM0 215 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rhox3hL7MU37 215 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rgs4O08899 205 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rab6bP61294 208 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Rhox3aQ4TU90 215 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Pick1Q62083 416 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Fastkd1Q6DI86 829 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Atg9bQ6EBV9 922 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zfp566Q8VCI1 386 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Bcat1P24288 386 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Ppm1nQ8BGL1 404 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 HpdlQ8K248 371 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Il31raQ8K5B1 716 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 CtsfQ9R013 462 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Slc4a9E9PUP3 929 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gm5160F8VPN3 147 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tdpoz3Q717B4 365 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zfp212G3X8R7 492 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Guca2bO09051 106 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Gramd1bQ80TI0 738 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Zfp418Q8BFS8 652 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Snx16Q8C080 344 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Dnajc5gQ8C632 165 aa13.12□□□□□ -0.31
Atg2b-201ENSMUST00000041055 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.9 ms