RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553077.5

NFATC3-208, Transcript of nuclear factor of activated T cells 3, human

TSL 2

Gene NFATC3, Length 3,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFATC3-208	ENST00000553077	PPP2R5D	Q14738	602 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM169	Q96HH4	297 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	NOX5	Q96PH1	765 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NFATC3-208	ENST00000553077	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	MSC	O60682	206 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CSF2RA	P15509	400 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	HAUS1	Q96CS2	278 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	EXTL3	O43909	919 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CEP104	O60308	925 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TH	P07101	528 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SPTBN2	O15020	2390 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TACC1	O75410	805 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CLTA	P09496	248 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	GNA15	P30679	374 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	KRT83	P78385	493 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	ALCAM	Q13740	583 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	PIDD1	Q9HB75	910 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	NFASC	O94856	1347 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	GJB6	O95452	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	OR4Q2	P0C623	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	UCHL3	P15374	230 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	PTEN	P60484	403 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	MORN1	Q5T089	497 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	WDR70	Q9NW82	654 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	USP27X	A6NNY8	438 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	MOCS3	O95396	460 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	C22orf31	O95567	290 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	IFNB1	P01574	187 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	GRIK1	P39086	918 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	NME3	Q13232	169 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	NCAPH	Q15003	741 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	GOLGA1	Q92805	767 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	ZWILCH	Q9H900	591 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	STK25	O00506	426 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	PRRG1	O14668	218 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	EPHB6	O15197	1021 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	B4GALT4	O60513	344 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	ICAM3	P32942	547 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	RTP1	P59025	263 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	CYB561D2	O14569	222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NFATC3-208	ENST00000553077	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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