RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	STAP2	Q9UGK3	403 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115		B5MCH6	92 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RASA4B	C9J798	803 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	WNT10B	O00744	389 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RASA4	O43374	803 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	ACAP1	Q15027	740 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PKN1	Q16512	942 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CEP95	Q96GE4	821 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	APOL5	Q9BWW9	433 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RSAD1	Q9HA92	442 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	NCDN	Q9UBB6	729 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	ZMYM3	Q14202	1370 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PAX4	O43316	350 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	NPR1	P16066	1061 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SERPINB3	P29508	390 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	KCNC1	P48547	511 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PIK3CG	P48736	1102 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CREM	Q03060	361 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SRL	Q86TD4	932 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	DPP9	Q86TI2	863 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	LGI4	Q8N135	537 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	STON2	Q8WXE9	905 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SUCLG2	Q96I99	432 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	TCF25	Q9BQ70	676 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	NELFA	Q9H3P2	528 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115		A0A1W2PRX2	142 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	UBE2QL1	A1L167	161 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	GRM6	O15303	877 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	B4GALT4	O60513	344 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RAP2A	P10114	183 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	ATP5J	P18859	108 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PIK3CB	P42338	1070 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CASP5	P51878	434 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SURF1	Q15526	300 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CERS3	Q8IU89	383 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC138	Q96M89	665 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	TBCB	Q99426	244 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	MRI1	Q9BV20	369 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RLIM	Q9NVW2	624 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CR2	P20023	1033 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SLC7A1	P30825	629 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PRIM2	P49643	509 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	ARFIP2	P53365	341 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	EPHB4	P54760	987 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	DOK3	Q7L591	496 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	GPR135	Q8IZ08	494 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	SGCZ	Q96LD1	299 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	CPA4	Q9UI42	421 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	MATN4	O95460	622 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	GNAI3	P08754	354 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	KIT	P10721	976 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PPP2CB	P62714	309 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	GNAI1	P63096	354 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	PPP2CA	P67775	309 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	BTK	Q06187	659 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	DUSP8	Q13202	625 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ETV1-223	ENST00000497115	KRT72	Q14CN4	511 aa		7.22	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms