RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 KCTD16Q68DU8 428 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 IQCKQ8N0W5 287 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CCT6BQ92526 530 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ZFATQ9P243 1243 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 ENC1O14682 589 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TIMM44O43615 452 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ZNF862O60290 1169 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SRGAP2O75044 1071 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GGPS1O95749 300 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 FAM200BP0CF97 657 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ALADP13716 330 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CASP14P31944 242 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 FAM167AQ96KS9 214 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GALNT8Q9NY28 637 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 EHHADHQ08426 723 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 POSTNQ15063 836 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CCDC38Q502W7 563 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 COPS5Q92905 334 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 MED15Q96RN5 788 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ZNF233A6NK53 670 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 KBTBD13C9JR72 458 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 PACS1Q6VY07 963 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 EML1O00423 815 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TRAPPC3O43617 180 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 RESP18Q5W5W9 173 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP4-211ENST00000485450 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NDST4Q9H3R1 872 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GUCA1BQ9UMX6 200 aa8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ANO9A1A5B4 782 aa8.23□□□□□ -1.09
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