RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 UBN1Q9NPG3 1134 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM150BA6NC51 233 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ECEL1O95672 775 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ARP10275 920 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DLGAP5Q15398 846 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MKL1Q969V6 931 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CEP63Q96MT8 703 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 UBR3Q6ZT12 1888 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TISP43B9A030 160 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CA4P22748 312 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R5EQ16537 467 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 COBLL1Q53SF7 1204 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TATDN1Q6P1N9 297 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ATG4AQ8WYN0 398 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ITFG2Q969R8 447 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IDI2Q9BXS1 227 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP69BQ9UJL9 534 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF831Q5JPB2 1677 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PHF2O75151 1096 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 KRT36O76013 467 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RARGP13631 454 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 YY1P25490 414 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SREBF1P36956 1147 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CPA2P48052 419 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MGAT5Q09328 741 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GALNTL6Q49A17 601 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ODR4Q5SWX8 454 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RINT1Q6NUQ1 792 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GSTA5Q7RTV2 222 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 OGFOD1Q8N543 542 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CKAP2Q8WWK9 683 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 HES6Q96HZ4 224 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GLT8D2Q9H1C3 349 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LY75O60449 1722 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PODXLO00592 558 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CES2O00748 559 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MTM1Q13496 603 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PRELID2Q8N945 189 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TTC1Q99614 292 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF577Q9BSK1 485 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PHTF1Q9UMS5 762 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 POLR2MP0CAP2 368 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA3P32297 505 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SP4Q02446 784 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TTC27Q6P3X3 843 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RFWD3Q6PCD5 774 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CYP4X1Q8N118 509 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD33BA6NCL7 494 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TXNDC9O14530 226 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PYGBP11216 843 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GSTT1P30711 240 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SGO2Q562F6 1265 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CEP128Q6ZU80 1094 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FAM81AQ8TBF8 368 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GRHL1Q9NZI5 618 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 WDR35Q9P2L0 1181 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 O00370 1275 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GYG2O15488 501 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CHKAP35790 457 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 VSTM1Q6UX27 236 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FAM178BQ8IXR5 827 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RASGEF1CQ8N431 466 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 AKT1S1Q96B36 256 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 HEMGNQ9BXL5 484 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CARD9Q9H257 536 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN3O15551 220 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K7O43318 606 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PIAS1O75925 651 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SLITRK3O94933 977 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FTLP02792 175 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 KRT17Q04695 432 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D25Q3MII6 688 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PALB2Q86YC2 1186 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LMNB1P20700 586 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MARK3P27448 753 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 VHLP40337 213 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 HYIQ5T013 277 aa17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms