RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ZNF445P59923 1031 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ENPEPQ07075 957 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SPAG1Q07617 926 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 NCAPHQ15003 741 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SPATA1Q5VX52 437 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 JADE1Q6IE81 842 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 THP07101 528 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TMC2Q8TDI7 906 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 FAM212AQ96EL1 285 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 FAM84AQ96KN4 292 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 LINC01553A4QN01 128 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CA3P07451 260 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 DLG4P78352 724 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 MYL5Q02045 173 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 BFSP1Q12934 665 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SURF1Q15526 300 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 RAB30Q15771 203 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 WDR49Q8IV35 697 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 KIF12Q96FN5 646 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CGRRF1Q99675 332 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 THAP9Q9H5L6 903 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.62■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ZNF165P49910 485 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TUSC3Q13454 348 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 FIBCD1Q8N539 461 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CXorf38Q8TB03 319 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 INTS13Q9NVM9 706 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 IKBKBO14920 756 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 GNA14O95837 355 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CYP3A5P20815 502 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 VAMP7P51809 220 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TAP1Q03518 808 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 IQCB1Q15051 598 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SPRED2Q7Z698 418 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ZNF516Q92618 1163 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CAVIN2O95810 425 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 DNAJB2P25686 324 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 LRPAP1P30533 357 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 GUCY2FP51841 1108 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SLC35C1Q96A29 364 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 FNBP1Q96RU3 617 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CBX8Q9HC52 389 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 MSRAQ9UJ68 235 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 GALTP07902 379 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TRIM49P0CI25 452 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TRIM49CP0CI26 452 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 KRT13P13646 458 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ZNF18P17022 549 aa21.58■■□□□ 1.05
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