RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 TSG101Q99816 390 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TIAM1Q13009 1591 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 H0YIV9 168 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PRKD3O94806 890 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ALBP02768 609 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CYP3A4P08684 503 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 IDO1P14902 403 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 MCM3P25205 808 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 GIPRP48546 466 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 FNTAP49354 379 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SLC8A3P57103 927 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 GUCA2AQ02747 115 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 BFSP1Q12934 665 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 MAPRE2Q15555 327 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SNCBQ16143 134 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SULF1Q8IWU6 871 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CDH26Q8IXH8 852 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SMARCE1Q969G3 411 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TRIM4Q9C037 500 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 KRT23Q9C075 422 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 DCTPP1Q9H773 170 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CERS4Q9HA82 394 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PSME2Q9UL46 239 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SATB2Q9UPW6 733 aa7.43□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 MAGEB16A2A368 324 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 M0R2C6 588 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TRAF5O00463 557 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 AP1G1O43747 822 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 EFCAB14O75071 495 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 KRT34O76011 436 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 IFNB1P01574 187 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 OR1G1P47890 313 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CARD18P57730 90 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 GALNT3Q14435 633 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 HS1BP3Q53T59 392 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 AAGABQ6PD74 315 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 FAM160B2Q86V87 743 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ATCAYQ86WG3 371 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 AHI1Q8N157 1196 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ARL14Q8N4G2 192 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.42□□□□□ -1.22
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms