RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 DNM1LO00429 736 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRN2O75325 713 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNA1P02708 482 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 STAG3L1P0CL83 205 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK17Q00537 523 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCEQ6IPM2 695 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR49Q8IV35 697 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA4DQ92854 862 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB118Q96PH6 123 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 CHP1Q99653 195 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB20Q9NX57 234 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO6Q9UM54 1294 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ANK1P16157 1881 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 AP3M2P53677 418 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 GJB7Q6PEY0 223 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM84AQ96KN4 292 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF208Q9H0X6 261 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 IL18RAPO95256 599 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RFX1P22670 979 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 JAM2P57087 298 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD9BQ6WBX8 426 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM228AQ86W67 206 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5B17Q8NGF7 314 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 KCND1Q9NSA2 647 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 OGDHLQ9ULD0 1010 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 B4GALT4O60513 344 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 NPTXRO95502 500 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL8P10145 99 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 THPOP40225 353 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 GRM5P41594 1212 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 MTF1Q14872 753 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SFMBT2Q5VUG0 894 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM212AQ96EL1 285 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 AIPL1Q9NZN9 384 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC12Q9UKB3 198 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 NOD1Q9Y239 953 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ARVCFO00192 962 aa26.9■■□□□ 1.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 CTSHP09668 335 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG5Q96R06 1193 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 STK33Q9BYT3 514 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF19Q8IW93 802 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ACAP3Q96P50 834 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 MROH7Q68CQ1 1323 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 CAND2O75155 1236 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS6KA5O75582 802 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 VNN1O95497 513 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DRAP01903 254 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 BIRC3Q13489 604 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 RAPGEF1Q13905 1077 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC10A6Q3KNW5 377 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM26DQ5JW98 314 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB13Q8IY85 973 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPV6Q9H1D0 765 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB7Q9H672 318 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa26.89■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 LACTBL1A8MY62 500 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK7P50613 346 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 HGSNATQ68CP4 663 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH12Q6ZR08 3092 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN11Q5T124 520 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR12Q9C0I1 747 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR88Q9GZN0 384 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 F8VZ95 297 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3CAP42336 1068 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-215ENST00000628018 ASIC2Q16515 512 aa26.86■■□□□ 1.89
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