RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616894.1

ATRNL1-210, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATRNL1, Length 1,701 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-210ENST00000616894 A0A1W2PQ27 194 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 A0A1W2PQ64 194 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 A0A1W2PQD8 194 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 HIDE1A8MVS5 230 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 SYKP43405 635 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 TUSC3Q13454 348 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 SNX27Q96L92 541 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PER2O15055 1255 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 TNFSF9P41273 254 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 NRIP1P48552 1158 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 HVCN1Q96D96 273 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PAGE5Q96GU1 130 aa25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 A0A0B4J269 797 aa25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 NR1I2O75469 434 aa25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 ZBP1Q9H171 429 aa25.22■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 LINC01565O15544 149 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM189A1O60320 539 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 CXCL8P10145 99 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 CA8P35219 290 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 XKR4Q5GH76 650 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 UNC13DQ70J99 1090 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 ACCSQ96QU6 501 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 TLE6Q9H808 572 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 CLDND1Q9NY35 253 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 COG5Q9UP83 839 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.21■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 HASPINQ8TF76 798 aa25.2■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.2■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.2■■□□□ 1.63
ATRNL1-210ENST00000616894 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 OGTO15294 1046 aa25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 COL19A1Q14993 1142 aa25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CNTN3Q9P232 1028 aa25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 USP25Q9UHP3 1055 aa25.2■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 C5orf42Q9H799 3197 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CTSAP10619 480 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 KCNA5P22460 613 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 EHHADHQ08426 723 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ALCAMQ13740 583 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.19■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 KIF4AO95239 1232 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CXCL14O95715 111 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CLTAP09496 248 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ADSSP30520 456 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SPAG1Q07617 926 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ANK1P16157 1881 aa25.18■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 EFEMP2O95967 443 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 KCNE1P15382 129 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ACOT2P49753 483 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CLCNKBP51801 687 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 DUSP6Q16828 381 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 KLRC4O43908 158 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF202O95125 648 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SOD2P04179 222 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 LTBRP36941 435 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 KCNQ1P51787 676 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms