RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555676.5

RBM23-216, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 4

Gene RBM23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-216	ENST00000555676	RAB27A	P51159	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SMTN	P53814	917 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	UBASH3A	P57075	661 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	UBE3A	Q05086	875 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	UBE4B	O95155	1302 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TNFRSF10A	O00220	468 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	BCAR1	P56945	870 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PLCB3	Q01970	1234 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ADAM15	Q13444	863 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	HES2	Q9Y543	173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PDXK	O00764	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PER2	O15055	1255 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NCK2	O43639	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	B4GALT3	O60512	393 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PLS3	P13797	630 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	IL9	P15248	144 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	AXL	P30530	894 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NRIP1	P48552	1158 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	STX17	P56962	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CLUL1	Q15846	466 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MED15	Q96RN5	788 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	IPP	Q9Y573	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	FSCN2	O14926	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	HIP1R	O75146	1068 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	TBX10	O75333	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	DDHD2	O94830	711 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM23-216	ENST00000555676	GALT	P07902	379 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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