RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 TMEM169Q96HH4 297 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 GSDMAQ96QA5 445 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 COLEC11Q9BWP8 271 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 LZTS1Q9Y250 596 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SZT2Q5T011 3432 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 EPOPA6NHQ4 379 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 NRP1O14786 923 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 LPXNO60711 386 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 DDHD2O94830 711 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ITGB1P05556 798 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 OR1G1P47890 313 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 CLCN6P51797 869 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 DSC1Q08554 894 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 KCNA1Q09470 495 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 TUSC3Q13454 348 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 BMT2Q1RMZ1 405 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 XKR4Q5GH76 650 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SLC39A4Q6P5W5 647 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ALKAL1Q6UXT8 129 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 COLGALT2Q8IYK4 626 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 GOLGA5Q8TBA6 731 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SPPL3Q8TCT6 385 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 PPP2R3CQ969Q6 453 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 UROC1Q96N76 676 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 HAPLN2Q9GZV7 340 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 MIOSQ9NXC5 875 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 CNTN3Q9P232 1028 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 HCSTQ9UBK5 93 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 TTC26A0AVF1 554 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 PTGESO14684 152 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 GRM6O15303 877 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 KCNE1P15382 129 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SLC11A1P49279 550 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 PPP2R3AQ06190 1150 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 STK4Q13043 487 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 PNOCQ13519 176 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ADGRE1Q14246 886 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SLC10A6Q3KNW5 377 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SEZ6Q53EL9 994 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 POF1BQ8WVV4 589 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SMARCE1Q969G3 411 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 IGSF21Q96ID5 467 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SNX27Q96L92 541 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ASB7Q9H672 318 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 TLR9Q9NR96 1032 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ANK1P16157 1881 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 MYO9BQ13459 2157 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 FSD2A1L4K1 749 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 EXTL3O43909 919 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 FAM189A1O60320 539 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 TADA2AO75478 443 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 IL18RAPO95256 599 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ADRB2P07550 413 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 CXCL8P10145 99 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ADSSP30520 456 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 RPL9P32969 192 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 PBX3P40426 434 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 TNFSF9P41273 254 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ACOT2P49753 483 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 TMC7Q7Z402 723 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 NELFCDQ8IXH7 590 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 GPD1LQ8N335 351 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SPATA20Q8TB22 786 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-224ENST00000551155 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms