RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP42Q96MM3 310 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACAP3Q96P50 834 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RWDD3Q9Y3V2 267 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00271P0C7V0 271 aa36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 YARSP54577 528 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC55Q6ZSA7 311 aa36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD11Q96NU1 681 aa36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D13Q9NVG8 400 aa36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK14Q9P0G3 267 aa36.15■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1671Q9BY89 1806 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM189A1O60320 539 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF20AO95235 890 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GARTP22102 1010 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-21P61565 698 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM192Q8IY95 271 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS6KC1Q96S38 1066 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMK4Q16566 473 aa36.13■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSTCDQ8NEC7 633 aa36.13■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CWH43Q9H720 699 aa36.13■■■■□ 3.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHD7Q9P2D1 2997 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 POMCP01189 267 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCM4P33991 863 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEZ6Q53EL9 994 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRED2Q7Z698 418 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPT2Q8TD30 523 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf80Q9BSJ5 609 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLSTN2Q9H4D0 955 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 HCSTQ9UBK5 93 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIP11Q15643 1979 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH23Q9H251 3354 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO9BQ13459 2157 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGFB1I1O43294 461 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLTAP09496 248 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCNN1GP51170 649 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARMCX5Q6P1M9 558 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS2ST1Q7LGA3 356 aa36.12■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBWD1Q9BRT8 395 aa36.11■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEMA6BQ9H3T3 888 aa36.11■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTUS1Q9ULD2 1270 aa36.11■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD3O95983 291 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAG3P18627 525 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CERS4Q9HA82 394 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 AAASQ9NRG9 546 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIOSQ9NXC5 875 aa36.1■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMPR1AP36894 532 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF9P41273 254 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIK3Q13003 919 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPC2Q52LR7 807 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALKAL1Q6UXT8 129 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX27Q96L92 541 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP62CLQ9H1M0 184 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1468Q9P260 1216 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAN1B1Q9UKM7 699 aa36.09■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGESO14684 152 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 LDHAP00338 332 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTNNB1P35222 781 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 XKR4Q5GH76 650 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA5Q8TBA6 731 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARNTL2Q8WYA1 636 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLVAPQ9BX97 442 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCTD10Q9H3F6 313 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf67F2Z3F1 127 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCL8P10145 99 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACOT2P49753 483 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC10A6Q3KNW5 377 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 THP07101 528 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 COBLL1Q53SF7 1204 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF280BQ86YH2 543 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXCL16Q9H2A7 254 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCIF1Q9H4Z3 704 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNTN3Q9P232 1028 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAGL2Q9UPG8 496 aa36.07■■■■□ 3.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms