RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRM5P41594 1212 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCNN1GP51170 649 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GUCD1Q96NT3 240 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAMD11Q96NU1 681 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GBP4Q96PP9 640 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GBP3Q9H0R5 595 aa22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 KINO60870 393 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXD13P35453 343 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 PBX3P40426 434 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK4Q13043 487 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A0B4J269 797 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 INPPL1O15357 1258 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 B4GALT3O60512 393 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYLIPQ8WY64 445 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.9■■□□□ 1.26
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDHD2O94830 711 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACAP3Q96P50 834 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM206Q9H813 350 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 AAASQ9NRG9 546 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.89■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAG3P18627 525 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADSSP30520 456 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMD2Q13200 908 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.88■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTGESO14684 152 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 OGTO15294 1046 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM189A1O60320 539 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 RHOBTB3O94955 611 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNFSF9P41273 254 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCAR1P56945 870 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPM6BQ13491 265 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF558Q96NG5 402 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLVAPQ9BX97 442 aa22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 H3BNC9 293 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 LPXNO60711 386 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 RB1P06400 928 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRE1Q14246 886 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLTAP09496 248 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNB1Q14721 858 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNX27Q96L92 541 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.86■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE4BO95155 1302 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITGB1P05556 798 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GALTP07902 379 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXCL8P10145 99 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGFBP4P22692 258 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACOT2P49753 483 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRIK3Q13003 919 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 P2RX5Q93086 422 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.85■■□□□ 1.25
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms