RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLUHO75153 1309 aa21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 RFPL2O75678 378 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 C1RP00736 705 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 PRKCBP05771 671 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLCN5P51795 746 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 ST3GAL1Q11201 340 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 TUSC3Q13454 348 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPP2R5AQ15172 486 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 IFT74Q96LB3 600 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 FNIP2Q9P278 1114 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 TGM5O43548 720 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 CYP11B2P19099 503 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 NAMPTP43490 491 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 TTC38Q5R3I4 469 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 SNTG2Q9NY99 539 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 ST18O60284 1047 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 GFRA3O60609 400 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 THP07101 528 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 MUTP22033 750 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 CEP57Q86XR8 500 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 HASPINQ8TF76 798 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 ACKR2O00590 384 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 RECQL4O94761 1208 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 RFX1P22670 979 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 EFNA5P52803 228 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 SIX5Q8N196 739 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 BSNDQ8WZ55 320 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 TTPALQ9BTX7 342 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYO10Q9HD67 2058 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 STK25O00506 426 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 SEC24BO95487 1268 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRAPPC10P48553 1259 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 LIN9Q5TKA1 542 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIFAP3Q92845 792 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 NXPE3Q969Y0 559 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 RAB34Q9BZG1 259 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 STK24Q9Y6E0 443 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KB1-208ENST00000489824 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIF4AO95239 1232 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 RTP2Q5QGT7 225 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDXDC1Q6P996 788 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYADMQ96S97 322 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 GDAQ9Y2T3 454 aa21.45■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PTGESO14684 152 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZMYND10O75800 440 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 CFHP08603 1231 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PSMD5Q16401 504 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 LILRA6Q6PI73 481 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 USP20Q9Y2K6 914 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 CACNA1HO95180 2353 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 AOC1P19801 751 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 K7ERI5 159 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 FSHRP23945 695 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1-208ENST00000489824 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms