RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ASIC4Q96FT7 647 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SGCZQ96LD1 299 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TBCBQ99426 244 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 POFUT1Q9H488 388 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF181Q9P0P0 153 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.85□□□□□ -1.31
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STRADBP1-201ENST00000478954 IPPQ9Y573 584 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCC6O95255 1503 aa6.85□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.84□□□□□ -1.31
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STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PQY0 241 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 F5H423 210 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 EXOC5O00471 708 aa6.84□□□□□ -1.31
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STRADBP1-201ENST00000478954 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CD53P19397 219 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 EDNRBP24530 442 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 EPHA5P54756 1037 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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STRADBP1-201ENST00000478954 TUSC3Q13454 348 aa6.84□□□□□ -1.31
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STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM5Q71RC9 77 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 NUP43Q8NFH3 380 aa6.84□□□□□ -1.31
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STRADBP1-201ENST00000478954 POF1BQ8WVV4 589 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 L1RE1Q9UN81 338 aa6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
STRADBP1-201ENST00000478954 MEGF6O75095 1541 aa6.84□□□□□ -1.31
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STRADBP1-201ENST00000478954 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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STRADBP1-201ENST00000478954 PGBD4Q96DM1 585 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC138Q96M89 665 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF114Q9Y508 228 aa6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0G2JLW4 131 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM227AF5H4B4 570 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 KRIT1O00522 736 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXP2O15409 715 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 SNX17Q15036 470 aa6.82□□□□□ -1.32
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STRADBP1-201ENST00000478954 PGS1Q32NB8 556 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 EMC4Q5J8M3 183 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 STEAP3Q658P3 488 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 RAX2Q96IS3 184 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 MYL10Q9BUA6 226 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 DPP7Q9UHL4 492 aa6.82□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 GLTPD2A6NH11 291 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 ACOT7O00154 380 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 TADA3O75528 432 aa6.81□□□□□ -1.32
STRADBP1-201ENST00000478954 NTRK1P04629 796 aa6.81□□□□□ -1.32
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