RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RNF43Q68DV7 783 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MYCT1Q8N699 235 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CD101Q93033 1021 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 AAASQ9NRG9 546 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RGL1Q9NZL6 768 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 WHRNQ9P202 907 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MTA2O94776 668 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 BCRP11274 1271 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 COG2Q14746 738 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD27Q96NW4 1050 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 DMAC2Q9NW81 257 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 VAV3Q9UKW4 847 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 UBE4BO95155 1302 aa15.99■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CHMP2AO43633 222 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CFBP00751 764 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 POLD1P28340 1107 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 KCNJ1P48048 391 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC174Q6PII3 467 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ACER1Q8TDN7 264 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MRIQ9BWK5 157 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL14Q9P2G3 628 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 PLSCR1O15162 318 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MSH4O15457 936 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2J2P51589 502 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 GDAP1Q8TB36 358 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 SLCO2A1Q92959 643 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC19Q9H756 370 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 SCN9AQ15858 1988 aa15.98■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 BRWD3Q6RI45 1802 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 BRAFP15056 766 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ACVR2BQ13705 512 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 BLMHQ13867 455 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 LMO3Q8TAP4 145 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 GMCL1Q96IK5 515 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEB18Q96M61 343 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 TP73O15350 636 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 STX2P32856 288 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 SREBF1P36956 1147 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CGB2Q6NT52 195 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RNF207Q6ZRF8 634 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 PARVGQ9HBI0 331 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 YDJCA8MPS7 323 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 EML1O00423 815 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 UNC5CO95185 931 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 GH1P01241 217 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MGAT5Q09328 741 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 BFSP1Q12934 665 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MPP2Q14168 576 aa15.97■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 TCEA3O75764 348 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 RAD17O75943 681 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 TTC4O95801 387 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 CDC25CP30307 473 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 MTFR1Q15390 333 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 STYK1Q6J9G0 422 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.96■□□□□ 0.15
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms