RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.39■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 FIBCD1Q8N539 461 aa24.38■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 ACAP3Q96P50 834 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 TGFB1I1O43294 461 aa24.38■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 LINC01553A4QN01 128 aa24.37■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.37■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 PRCPP42785 496 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 ACOT2P49753 483 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 SCNN1GP51170 649 aa24.36■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.36■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 CDH23Q9H251 3354 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 FAM189A1O60320 539 aa24.35■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.35■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXD4-201ENST00000306324 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.34■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 SNX27Q96L92 541 aa24.33■■□□□ 1.49
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HOXD4-201ENST00000306324 ADSSL1Q8N142 457 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 GPD1LQ8N335 351 aa24.32■■□□□ 1.48
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HOXD4-201ENST00000306324 CERS4Q9HA82 394 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 EXTL3O43909 919 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD4-201ENST00000306324 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.32■■□□□ 1.48
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