RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	MYL7	Q01449	175 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	DUPD1	Q68J44	220 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ERICH1	Q86X53	443 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	PRELID2	Q8N945	189 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	NFKBIE	O00221	500 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	PYGM	P11217	842 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	STX2	P32856	288 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	SESN3	P58005	492 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	MKL1	Q969V6	931 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	TLCD1	Q96CP7	247 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	SORBS3	O60504	671 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	SPAG7	O75391	227 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	PSEN1	P49768	467 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	DLG4	P78352	724 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	JDP2	Q8WYK2	163 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ENTPD3	O75355	529 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	PIAS1	O75925	651 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT16	P08779	473 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	STAT2	P52630	851 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	DYDC2	Q96IM9	177 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	C9orf72	Q96LT7	481 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SPIN3-222	ENST00000639482	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	PDXK	O00764	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	BRAF	P15056	766 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	DCAF4	Q8WV16	495 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM237	Q96Q45	408 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	MGRN1	O60291	552 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	MMP13	P45452	471 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	RIPK2	O43353	540 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	THAP12	O43422	761 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	SUN1	O94901	812 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	PDHA1	P08559	390 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	CHKA	P35790	457 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE6C	P51160	858 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	CNGA2	Q16280	664 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	PRKCI	P41743	596 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	NCALD	P61601	193 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SPIN3-222	ENST00000639482	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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